Koenzým B

	Koenzým B
	Koenzým B
	Všeobecné vlastnosti
Sumárny vzorec	C11H22NO7PS
Systematický názov	Kyselina 2--3-fosfónooxybutánová
Synonymá	7-merkaptoheptanoyltreonínfosfát
	Fyzikálne vlastnosti
Molárna hmotnosť	343,334 g/mol
	Ďalšie informácie
Číslo CAS	104302-77-4
	Pokiaľ je to možné a bežné, používame jednotky sústavy SI. ; Ak nie je hore uvedené inak, údaje sú za normálnych podmienok.
	Chemický portál

Koenzým B (HS–CoB alebo CoB) je koenzým, ktorý sa účastní redoxných reakcií u metanogénov. Jeho celý názov je 7-merkaptoheptanoyltreonínfosfát.^[1] Táto zlúčenina obsahuje tiolovú skupinu, ktorá je hlavným reakčným miestom.

Význam v metanogenéze

Koenzým B je dôležitou súčasťou posledného kroku biogenézy metánu.^[2] Pôsobí ako donor dvoch elektrónov pri redukcii koenzýmu M (metylkoenzýmu) na dve molekuly, a to metán a heterodisulfid.^[3] Dva rôzne experimenty boli uskutočnené, jeden s koenzýmom B a druhý bez koenzýmu B, čo naznačilo, že použitie koenzýmu B pred tvorbou metánu má za následok účinnejšie a konzistentnejšie štiepenie väzby.^[4]

Koenzým B reaguje s S-metyltioetánsulfonátom (metylkoenzýmom M, ktorý sa zapisuje ako CH₃–S–CoM), čím sa uvoľňuje metán v metanogenéze:^[5]

CH₃–S–CoM + HS–CoB → CH₄ + CoB–S–S–CoM

Túto reakciu katalyzuje enzým metylkoenzým M reduktáza, ktorá obsahuje kofaktor F430 ako prostetickú skupinu.

Podobná reakcia, ktorá využíva HS–CoB i –CoM, je redukcia fumarátu na sukcinát, ktorú katalyzuje fumarátreduktáza:^[6]

HS–CoM + HS–CoB + ⁻O₂CCH=CHCO₂⁻ → ⁻O₂CCH₂–CH₂CO₂⁻ + CoB–S–S–CoM

Referencie

↑ Structure of component B (7-mercaptoheptanoylthreonine phosphate) of the methylcoenzyme M methylreductase system of Methanobacterium thermoautotrophicum. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1986, s. 4238–42. DOI: 10.1073/pnas.83.12.4238. PMID 3086878.
↑ Detection of Organometallic and Radical Intermediates in the Catalytic Mechanism of Methyl-Coenzyme M Reductase Using the Natural Substrate Methyl-Coenzyme M and a Coenzyme B Substrate Analogue. Biochemistry (Easton), 2010-12-22, s. 10902–10911. Dostupné online. DOI: 10.1021/bi101562m. PMID 21090696.
↑ Structural Insight into Methyl-Coenzyme M Reductase Chemistry Using Coenzyme B Analogues.. Biochemistry (Easton), 2010-07-22, s. 7683–7693. DOI: 10.1021/bi100458d. PMID 20707311.
↑ Mechanistic Studies of Methane Biogenesis by Methyl-Coenzyme M Reductase: Evidence that Coenzyme B Participates in Cleaving the C−S Bond of Methyl-Coenzyme M. Biochemistry (Easton), 2001-10-30, s. 12875–12885. Dostupné online. DOI: 10.1021/bi011196y. PMID 11669624.
↑ Thauer RK. Biochemistry of methanogenesis: a tribute to Marjory Stephenson. 1998 Marjory Stephenson Prize Lecture. Microbiology, September 1998, s. 2377–406. Dostupné online . DOI: 10.1099/00221287-144-9-2377. PMID 9782487. Archivované 2020-05-17 na Wayback Machine
↑ Thiol:fumarate reductase (Tfr) from Methanobacterium thermoautotrophicum—identification of the catalytic sites for fumarate reduction and thiol oxidation. Eur. J. Biochem., April 1998, s. 292–9. DOI: 10.1046/j.1432-1327.1998.2530292.x. PMID 9578488.

Zdroj

Tento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Coenzyme B na anglickej Wikipédii.

Tento článok týkajúci sa chémie je zatiaľ „výhonok“. Pomôž Wikipédii tým, že ho doplníš a rozšíriš.

Zdroj:
Text je dostupný za podmienok Creative Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších podmienok. Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky použitia.

[1] Structure of component B (7-mercaptoheptanoylthreonine phosphate) of the methylcoenzyme M methylreductase system of Methanobacterium thermoautotrophicum. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1986, s. 4238–42. DOI: 10.1073/pnas.83.12.4238. PMID 3086878.

[2] Detection of Organometallic and Radical Intermediates in the Catalytic Mechanism of Methyl-Coenzyme M Reductase Using the Natural Substrate Methyl-Coenzyme M and a Coenzyme B Substrate Analogue. Biochemistry (Easton), 2010-12-22, s. 10902–10911. Dostupné online. DOI: 10.1021/bi101562m. PMID 21090696.

[3] Structural Insight into Methyl-Coenzyme M Reductase Chemistry Using Coenzyme B Analogues.. Biochemistry (Easton), 2010-07-22, s. 7683–7693. DOI: 10.1021/bi100458d. PMID 20707311.

[4] Mechanistic Studies of Methane Biogenesis by Methyl-Coenzyme M Reductase: Evidence that Coenzyme B Participates in Cleaving the C−S Bond of Methyl-Coenzyme M. Biochemistry (Easton), 2001-10-30, s. 12875–12885. Dostupné online. DOI: 10.1021/bi011196y. PMID 11669624.

[5] Thauer RK. Biochemistry of methanogenesis: a tribute to Marjory Stephenson. 1998 Marjory Stephenson Prize Lecture. Microbiology, September 1998, s. 2377–406. Dostupné online . DOI: 10.1099/00221287-144-9-2377. PMID 9782487. Archivované 2020-05-17 na Wayback Machine

[6] Thiol:fumarate reductase (Tfr) from Methanobacterium thermoautotrophicum—identification of the catalytic sites for fumarate reduction and thiol oxidation. Eur. J. Biochem., April 1998, s. 292–9. DOI: 10.1046/j.1432-1327.1998.2530292.x. PMID 9578488.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]