Salmonella

	Salmonela
Vedecká klasifikácia
Doména	baktérie (Bacteria)
Ríša (regnum)	baktérie (Bacteria)
Kmeň (phylum)	proteobaktérie (Proteobacteria)
Trieda (classis)	gama-proteobaktérie (Gammaproteobacteria)
Rad (ordo)	enterobaktérie (Enterobacteriales)
Čeľaď (familia)	Enterobacteriaceae
Rod (genus)	salmonela (Salmonella)
Vedecký názov
	Salmonella
	Vedecká klasifikácia prevažne podľa tohto článku

Salmonela (lat. Salmonella) je rod baktérií z čeľade Enterobacteriaceae.

Sú to gramnegatívne, fakultatívne anaeróbne tyčinkovité baktérie.

Systematika

Podľa Ewing 1963^[1]:
rod salmonela (Salmonella):

Podľa Kauffmanna 1960 a 1966 sa rod salmonela delí na veľa druhov (jednému sérovaru zodpovedá jeden druh) a tieto druhy sú zoskupené do 4 podrodov (I až IV).^[1] Neskôr bolo toto delenie rozšírené o dva podrody, tretí podrod bol rozdelený na dva a alternatívne sa namiesto podrodov hovorilo o (číslovaných) poddruhoch^[2]^[3]:
rod salmonela (Salmonella):

podrod I/poddruh I (zodpovedá neskoršiemu poddruhu Salmonella enterica subsp. enterica)
podrod II/poddruh II (zodpovedá neskoršiemu poddruhu Salmonella enterica subsp. salamae)
podrod IIIa/poddruh IIIa (zodpovedá neskoršiemu poddruhu Salmonella enterica subsp. arizonae)
podrod IIIb/poddruh IIIb (zodpovedá neskoršiemu poddruhu Salmonella enterica subsp. diarizonae)
podrod IV/poddruh IV (zodpovedá neskoršiemu poddruhu Salmonella enterica subsp. houtenae)
podrod V/poddruh V (zodpovedá neskoršiemu druhu Salmonella bongori)
podrod VI/poddruh VI (zodpovedá neskoršiemu poddruhu Salmonella enterica subsp. indica).

Podľa Le Minor et al. 1970^[1]:
rod salmonela (Salmonella):

Salmonella kauffmannii (zodpovedá Kauffmanovmu podrodu I)
Salmonella salamae (zodpovedá Kauffmanovmu podrodu II)
Salmonella arizonae (zodpovedá Kauffmanovmu podrodu III)
Salmonella houtenae (zodpovedá Kauffmanovmu podrodu IV)

Podľa Skerman et al. 1980^[1]:
rod salmonela (Salmonella):

Podľa časti bakteriológov koncom 20. storočia^[4]^[5]:
rod salmonela (Salmonella):

Salmonella choleraesuis
- poddruh Salmonella choleraesuis subsp. arizonae - alternatívne uvádzané ako druh Salmonella arizonae
- poddruh Salmonella choleraesuis subsp. bongori - alternatívne uvádzané ako druh Salmonella bongori
- poddruh Salmonella choleraesuis subsp. choleraesuis
- poddruh Salmonella choleraesuis subsp. diarizonae
- poddruh Salmonella choleraesuis subsp. houtenae
- poddruh Salmonella choleraesuis subsp. indica
- poddruh Salmonella choleraesuis subsp. salamae
Salmonella enteritidis
Salmonella paratyphi - alternatívne uvádzané ako druhy Salmonella paratyphi B (=Salmonella schottmueller) a Salmonella paratyphi C(Salmonella hirschfeldii)
Salmonella typhi
Salmonella typhimurium

Podľa Le Minor - Popoff 1987^[1]^[6]:
rod salmonela (Salmonella):

Salmonella enterica (vrátane: Salmonella choleraesuis) - t.j. rod salmonela pozostáva len z jedného druhu
- poddruh Salmonella enterica subsp. arizonae/poddruh IIIa
- poddruh Salmonella enterica subsp. bongori/poddruh V
- poddruh Salmonella enterica subsp. diarizonae/poddruh IIIb
- poddruh Salmonella enterica subsp. enterica/poddruh I (vrátane: Salmonella enteritidis, Salmonella paratyphi, Salmonella typhi a Salmonella typhimurium)
- poddruh Salmonella enterica subsp. houtenae/poddruh IV
- poddruh Salmonella enterica subsp. indica /poddruh VI
- poddruh Salmonella enterica subsp. salamae/poddruh II

Podľa Tindall et al. 2005/IUMS 2002^[4], detto podľa NCBI (stav 2021)^[7]:
rod salmonela (Salmonella):

viacero potenciálnych druhov incertae sedis
Salmonella bongori (homotypické synonymá: Salmonella enterica subsp. bongori a Salmonella choleraesuis subsp. bongori)
Salmonella enterica (vrátane: Salmonella choleraesuis)
- poddruh Salmonella enterica subsp. arizonae (homotypické synonymá: Salmonella arizonae a Salmonella choleraesuis subsp. arizonae)
- poddruh Salmonella enterica subsp. diarizonae (homotypické synonymum: Salmonella choleraesuis subsp. diarizonae)
- poddruh Salmonella enterica subsp. enterica (vrátane: Salmonella choleraesuis subsp. choeraesuis, Salmonella enteritidis, Salmonella paratyphi, Salmonella typhi a Salmonella typhimurium).
- poddruh Salmonella enterica subsp. houtenae (homotypické synonymum: Salmonella choleraesuis subsp. houtenae)
- poddruh Salmonella enterica subsp. indica (homotypické synonymum: Salmonella choleraesuis subsp. indica)
- poddruh Salmonella enterica subsp. salamae (homotypické synonymum: Salmonella choleraesuis subsp. salamae)

Podľa GTDB 2021^[8]:
Rod salmonela (Salmonella):

V roku 2004 bol publikovaný druh Salmonella subterranea. O tomto druhu však najneskôr v roku 2010 už bol známe, že do rodu salmonela nepatrí a v roku 2016 bol nakoniec preradený do rodu Atlantibacter a teraz sa teda volá Atlantibacter subterranea.^[9]

V praxi je v súčasnosti rozšírené delenie rodu salmonela (priamo) na sérovary (sérotypy), ktoré sa označuje ako Kauffmannova-Whiteova schéma; ide o aktualizáciu vyššie spomínaného systému Kauffmanna zo 60. rokov. V roku 2003 bolo podľa tejto schémy známych 2500 sérovarov salmonel. Typickými príkladmi sú sérovary Typhi, Typhimurium, Enteritidis, atď., ale mnohé sérovary nemajú slovné meno, len značku (napr. sérovar 51:z4,z23:-).^[5]^[2]

Zdroje

↑ ^a ^b ^c ^d ^e LE MINOR, POPOFF: Designation of Salmonella enterica sp. nov., norn. rev., as the Type and Only Species of the Genus Salmonella. In: INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC BACTERIOLOGY, Oct. 1987 ^{[nefunkčný odkaz}
↑ ^a ^b Grimont, Patrick. "Antigenic formulae of the Salmonella serovars, 9th edition". WHO Collaborating Centre for Reference and Research on Salmonella
↑ Yi-Wei Tang; SAILS, Andrew. Molecular Medical Microbiology. : Academic Press, 2014. 2216 s. Dostupné online. ISBN 978-0-12-397763-2. S. 1276.
↑ ^a ^b EUZÉBY, J.P.. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature - Genus Salmonella . . Dostupné online. Archivované 2011-11-08 z originálu. (anglicky)
↑ ^a ^b Salmonella. In: Lexikón lekárskej bakteriológie 2013, S. 122-123
↑ BEDNÁŘ, Marek; SOUČEK, Andrej; VÁVRA, Jiří. Lekařská speciální mikrobiologie a parazitologie. Praha : Triton, 1994. ISBN 80-901521-4-7. Kapitola rod Salmonella, s. 90. (česky)
↑ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=590
↑ https://gtdb.ecogenomic.org/
↑ https://lpsn.dsmz.de/species/salmonella-subterranea

Zdroj:
Text je dostupný za podmienok Creative Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších podmienok. Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky použitia.

[MP-1] LE MINOR, POPOFF: Designation of Salmonella enterica sp. nov., norn. rev., as the Type and Only Species of the Genus Salmonella. In: INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC BACTERIOLOGY, Oct. 1987 ^{[nefunkčný odkaz}

[Grim-2] Grimont, Patrick. "Antigenic formulae of the Salmonella serovars, 9th edition". WHO Collaborating Centre for Reference and Research on Salmonella

[3] Yi-Wei Tang; SAILS, Andrew. Molecular Medical Microbiology. : Academic Press, 2014. 2216 s. Dostupné online. ISBN 978-0-12-397763-2. S. 1276.

[Euzeby-4] EUZÉBY, J.P.. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature - Genus Salmonella . . Dostupné online. Archivované 2011-11-08 z originálu. (anglicky)

[Lex-5] Salmonella. In: Lexikón lekárskej bakteriológie 2013, S. 122-123

[6] BEDNÁŘ, Marek; SOUČEK, Andrej; VÁVRA, Jiří. Lekařská speciální mikrobiologie a parazitologie. Praha : Triton, 1994. ISBN 80-901521-4-7. Kapitola rod Salmonella, s. 90. (česky)

[7] ttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=590

[8] ttps://gtdb.ecogenomic.org/

[9] ttps://lpsn.dsmz.de/species/salmonella-subterranea

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]