O rovnomennej planétke pozri 22203 Prothoenor.

Prothoénor alebo Prothoénór (starogr. Προθοήνωρ – Prothoénor, iný prepis Prothoénór, lat. Prothoenor) je v gréckej mytológii syn Aréilyka a Thebuly, (podľa Diodora bol synom Archilyka) bol jedným z boiótskych vodcov v trójskej vojne.

Keď trójsky princ Paris uniesol spartskému kráľovi Menelaovi jeho manželku Helenu, Prothoénor a jeho bratia z Boiótie, ako aj mnoho iných Achájcov prijali výzvu mykénskeho vládcu Agamemnóna, aby sa zúčastnili na výprave proti Tróji. Druhý spev Homérej Iliady, ktorý je rozsiahlou prehliadkou achájskych krajín, ich vodcov a počtu lodí, na ktorých ich ozbrojené sily priplávali k Tróji o tom uvádza: „Boióťanom Léitos a Péneleós na čele stáli, Arkesilaos a tiež Klonios, chrabrý Prothoénor, ktorí prebývali v Hyrsku a sídlili v Aulide skalnatej, v Schoine a Skóle a pri Eteóne pahorkovitom, potom v Thespeii a Graii a v priestornom Mykalesse, ktorí mali Harmu, Eilesion a Erythry za svoje sídlo.." Podľa Hygina Prothoénor z boiótskeho mesta Thespiai priplával k brehom Tróje s vojskom na ôsmich lodiach.

Trójska vojna potom trvala desať rokov a priniesla Tróji skazu. Vyžiadala si mnoho mŕtvych a zahynul v nej aj Prothoénor, ktorého zabil oštepom trójsky hrdina Polydamas.