A | B | C | D | E | F | G | H | CH | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Y | Z | 0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9
| Fosfopantotenát-cysteín ligáza z E. coli v komplexe s CTP, PDB 1U7Z | |
| Identifikátory | |
|---|---|
| Číslo EC | EC 6.3.2.5 |
| Číslo CAS | 9023-50-1 |
| Databázy | |
| IntEnz | hľadať v IntEnz |
| BRENDA | hľadať v BRENDA |
| ExPASy | hľadať v ExPASy |
| KEGG | hľadať v KEGG |
| MetaCyc | hľadať v MetaCyc |
| PDB štruktúry | RSCB PDB PDBe PDBsum |
Fosfopantotenát-cysteín ligáza alebo fosfopantotenoylcysteínsyntetáza (PPCS alebo CoaB; EC 6.3.2.5 a EC 6.3.2.51, pozri nižšie) je enzým, ktorý katalyzuje nasledujúcu chemickú reakciu:
- NTP + 4'-fosfopantotenát + L-cysteín NMP + PPi + 4'-fosfopantotenoylcysteín
Substráty tohto enzýmu sú teda nukleozidtrifosfát (NTP), 4'-fosfopantotenát a cysteín, jeho produkty sú nukleozidmonofosfát (NMP), pyrofosfát (PPi) a 4'-fosfopantotenoylcysteín.
Klasifikácia
Tento enzým patrí medzi ligázy, konkrétne tie, ktoré katalyzujú tvorbu väzby uhlík-dusík medzi kyselinou a aminokyselinou (syntázy peptidov). Systematický názov tohto enzýmu je (R)-4'-fosfopantotenát:L-cysteín ligáza.
Význam
Táto reakcia predstavuje druhý z piatich krokov premeny pantotenátu na koenzým A. Predchádzajúci krok katalyzuje pantotenátkináza, nasledujúci krok katalyzuje fosfopantotenoylcysteíndekarboxyláza.
Gén
Tento enzým je u ľudí kódovaný génom PPCS.
Nezávisle na sebe bolo zistené, že gén dfp u E. coli má fosfopantotenoylcysteínsyntetázovú a fosfopantotenoylcysteíndekarboxylázovú aktivitu. Jednotlivé domény a k nim prislúchajúce gény, plus homológne gény, ktoré majú len jednu z týchto aktivít, boli neskôr premenované na coaB a coaC. Na základe toho sa PPCS niekedy označuje i ako CoaB, podľa génu, ktorý ju kóduje. Bifunkčný enzým sa potom označuje ako CoaBC.
Štruktúra
Rôzne organizmy využívajú v tejto reakcii rôzne NTP. PPCS z baktérie Escherichia coli využíva cytidíntrifosfát (CTP) ako zdroj energie, zatiaľ čo ľudská izoforma tohto enzýmu využíva adenozíntrifosfát (ATP). Na základe toho má tento enzým priradené dve rôzne čísla EC: 6.3.2.5 pre enzýmy využívajúce CTP a 6.3.2.51 pre enzýmy využívajúce ATP.
U drvivej väčšiny prokaryotov, vrátane Mycobacterium tuberculosis, je tento enzým súčasťou bifunkčného enzýmu, ktorý má zároveň i fosfopantotenoylcysteíndekarboxylázovú aktivitu.
Na konci roka 2023 bolo známych 12 štruktúr tohto enzýmu, s PDB kódmi 5INT, 4QJI, 1U7U, 1U7W, 1U7Z, 1U80, 6THC, 6TGV, 6TH2 a 1P9O pre EC 6.3.2.5 a PDB kódmi 1P9O a 7EDZ pre EC 6.3.2.51. Štruktúry pre rôzne čísla EC majú rôznu sekvenciu, ale ten istý fold.
Referencie
- ↑ a b ENZYME - 6.3.2.5 phosphopantothenate--cysteine ligase (CTP) . enzyme.expasy.org, . Dostupné online.
- ↑ a b ENZYME - 6.3.2.51 phosphopantothenate--cysteine ligase (ATP) . enzyme.expasy.org, . Dostupné online.
- ↑ a b LEONARDI, Roberta; JACKOWSKI, Suzanne. Biosynthesis of Pantothenic Acid and Coenzyme A. EcoSal Plus, 2007-09-13, roč. 2, čís. 2. Dostupné online . ISSN 2324-6200. DOI: 10.1128/ecosalplus.3.6.3.4. (po anglicky)
- ↑ MENDES, Vitor; GREEN, Simon R.; EVANS, Joanna C.. Inhibiting Mycobacterium tuberculosis CoaBC by targeting an allosteric site. Nature Communications, 2021-01-08, roč. 12, čís. 1, s. 143. Dostupné online . ISSN 2041-1723. DOI: 10.1038/s41467-020-20224-x. (po anglicky)
- ↑ Entrez Gene: Phosphopantothenoylcysteine synthetase . . Dostupné online.
- ↑ Structure of human phosphopantothenoylcysteine synthetase at 2.3 A resolution. Structure, Aug 2003, s. 927–936. DOI: 10.1016/S0969-2126(03)00146-1. PMID 12906824.
- ↑ MENDES, Vitor; GREEN, Simon R.; EVANS, Joanna C.. Inhibiting Mycobacterium tuberculosis CoaBC by targeting an allosteric site. Nature Communications, 2021-01-08, roč. 12, čís. 1, s. 143. Dostupné online . ISSN 2041-1723. DOI: 10.1038/s41467-020-20224-x. (po anglicky)
Ďalšia literatúra
- Brown GM. The metabolism of pantothenic acid. J. Biol. Chem., 1959, s. 370–8. DOI: 10.1016/S0021-9258(18)70307-4. PMID 13630913.
- Phosphopantothenoylcysteine synthetase from Escherichia coli Identification and characterization of the last unidentified coenzyme A biosynthetic enzyme in bacteria. J. Biol. Chem., 2001, s. 13513–6. DOI: 10.1074/jbc.C100033200. PMID 11278255.
- Kupke T. Molecular characterization of the 4'-phosphopantothenoylcysteine synthetase domain of bacterial dfp flavoproteins. J. Biol. Chem., 2002, s. 36137–45. DOI: 10.1074/jbc.M206188200. PMID 12140293.
Zdroj
upraviť | upraviť zdrojTento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Phosphopantothenate—cysteine ligase na anglickej Wikipédii.
Text je dostupný za podmienok Creative Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších podmienok. Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky použitia.
Antropológia
Aplikované vedy
Bibliometria
Dejiny vedy
Encyklopédie
Filozofia vedy
Forenzné vedy
Humanitné vedy
Knižničná veda
Kryogenika
Kryptológia
Kulturológia
Literárna veda
Medzidisciplinárne oblasti
Metódy kvantitatívnej analýzy
Metavedy
Metodika
Text je dostupný za podmienok Creative
Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších
podmienok.
Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky
použitia.
www.astronomia.sk | www.biologia.sk | www.botanika.sk | www.dejiny.sk | www.economy.sk | www.elektrotechnika.sk | www.estetika.sk | www.farmakologia.sk | www.filozofia.sk | Fyzika | www.futurologia.sk | www.genetika.sk | www.chemia.sk | www.lingvistika.sk | www.politologia.sk | www.psychologia.sk | www.sexuologia.sk | www.sociologia.sk | www.veda.sk I www.zoologia.sk
