Aspartátaminotransferáza - Biblioteka.sk

Panta Rhei Doprava Zadarmo


A | B | C | D | E | F | G | H | CH | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Y | Z | 0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9

Aspartátaminotransferáza

Aspartátaminotransferáza z E. coli viazaná na kofaktor pyridoxalfosfát.
Identifikátory
Číslo ECEC 2.6.1.1
Číslo CAS9000-97-9
Databázy
IntEnzhľadať v IntEnz
BRENDAhľadať v BRENDA
ExPASyhľadať v ExPASy
KEGGhľadať v KEGG
MetaCychľadať v MetaCyc
PDB štruktúryRSCB PDB PDBe PDBsum

Aspartátaminotransferáza je transaminačný enzým využívajúci pyridoxalfosfát (PLP), ktorý bol prvýkrát popísaný Arthurom Karmenom a jeho kolegami v roku 1954. AST katalyzuje reverzibilný prenos α-amínoskupiny medzi aspartátom a glutamátom, čo z neho robí významný enzým v metabolizme aminokyselín. AST sa nachádza v pečeni, srdci, kostrových svaloch, obličkách, mozgu a červených krvinkách. Hladina AST v krvi, hladina ALT (alanínaminotransferáza) v krvi a ich pomer (pomer AST/ALT) sú bežne merané klinické biomarkery pre poruchy pečene. Tieto skúšky sú bežne súčasťou krvných testov.

Polčas celkového AST v obehu je asi 17 hodín a asi 87 hodín (v priemere) pre mitochondriálnu AST.

Názvy

Aspartátaminotransferáza sa označuje i ako aspartáttransamináza, AST/AspAT/AAT alebo (sérová) glutamátoxalacetáttransamináza (GOT, SGOT). Jej systémový názov je L-aspartát:2-oxoglutarátaminotransferáza.

Funkcia

Reakcia katalyzovaná AST

Aspartátaminotransferáza katalyzuje konverziu aspartátu a α-ketoglutarátu na oxalacetát a glutamát:

L-aspartát (Asp) + α-ketoglutarát ↔ oxalacetát + L-glutamát (Glu)

Ako typická transamináza využíva PLP (vitamín B6) ako kofaktor na prenos amínovej skupiny z aspartátu alebo glutamátu na príslušnú ketokyselinu. Počas tejto reakcie sa kofaktor mení z PLP na pyridoxamínfosfát (PMP) a naspäť. Prenos amínoskupiny katalyzovaný týmto enzýmom je rozhodujúci pre degradáciu aminokyselín aj ich biosyntézu. Pri degradácii po premene z α-ketoglutarátu na glutamát prebieha oxidatívna deaminácia glutamátu, čím vznikajú amónne ióny, ktoré sa následne vylučujú v podobe močoviny. V opačnej reakcii sa syntetizuje aspartát z oxalacetátu, čo je kľúčový intermediát citrátového cyklu.

Izoenzýmy

V mnohých eukaryotoch sú prítomné dva izoenzýmy. U ľudí su to konkrétne:

Tieto izoenzýmy sa pravdepodobne vyvinuli zo spoločného predka AST cez duplikáciu génov a ich sekvenčná homológia je asi 45%.

AST sa takisto našla u mnohých mikroorganizmov, napríklad E. coli, H. mediterranei, a T. thermophilus. U E. coli je AST kódovaná génom aspC a bolo preukázané, že takisto vykazuje aktivitu transaminácie aromatických aminokyselín.

Štruktúra

Štruktúra AST z mitochondrií z kuracieho srdca

Štruktúra AST z rôznych zdrojov (napríklad kuracie mitochondrie, cytozol srdca z prasaťa, E. coli) bola určená v rôznych výskumoch pomocou röntgenovej kryštalografie. Celkovo je trojdimenzionálna štruktúra polypeptidu pre všetky organizmy veľmi podobná. AST existuje v podobe diméru, zloženého z dvoch identických podjednotiek, z ktorých každá má 400 aminokyselín a molekulovú hmotnosť asi 45 kDa. Obe podjednotky sa skladajú z veľkej a malej domény a k tomu ešte z tretej domény pozostávajúcej z N-terminálnych reziduí 3-14; týchto pár reziduí tvorí vlákno, ktoré spája a stabilizuje podjednotky diméru. Veľká doména, ktorá sa skladá z reziduí 48-325, viaže kofaktor PLP cez aldimínovú väzbu na ε-amínovej skupine Lys258. Ďalšie reziduá tejto domény - Asp222 a Tyr225 - takisto interagujú s PLP pomocou vodíkových väzieb. Malá doména pozostáva z reziduí 15-47 a 326-410 a reprezentuje flexibilný región, ktorý mení enzým z "otvorenej" do "zatvorenej" konformácie po naviazaní substrátu.1617

Dve nezávislé aktívne miesta sa nachádzajú poblíž rozhrania medzi doménami. V každom aktívnom mieste je dvojica arginínových reziduí, ktoré sú zodpovedné za špecificitu pre dikarboxylové kyseliny: Arg386 interaguje s proximálnou (α-)karboxylovou skupinou substrátu, zatiaľ čo Arg292 interaguje s distálnou karboxylovou skupinou (vo vedľajšom reťazci).1316

Čo sa týka sekundárnej štruktúry, AST obsahuje α i β prvky. Každá doména má centrálny list tvorený β-vláknami, ktorý je obklopený α-helixmi na oboch stranách.chýba zdroj

Aspartátaminotrasferáza, tak ako všetky transaminázy, využíva rozpoznanie dvoch rôznych substrátov - rozpoznáva a selektívne viaže dve aminokyseliny (Asp a Glu) s rôznymi postrannými reťazcami.18 V oboch prípadoch pozostáva transaminačná reakcia z dvoch podobných polreakcií, čo sa zvyčajne označuje ako ping-pongový mechanizmus. V prvej polreakcii sa viaže aminokyselina 1 (napr. L-Asp), ktorá reaguje s komplexom enzým-PLP za vzniku ketokyseliny 1 (oxalacetátu) a modifikovaného komplexu enzým-PMP. V druhej polreakcii sa viaže ketokyselina 2 (α-ketoglutarát) a reaguje s komplexom enzým-PMP za vzniku aminokyseliny 2 (L-Glu), čím sa regeneruje pôvodný komplex enzým-PLP. Tvorba racemického produktu (D-Glu) je veľmi vzácna.19

Špecifické kroky polreakcie enzým-PLP + aspartát ⇌ enzým-PMP + oxalacetát sú v obrázku nižšie; druhá polreakcia (nie je na obrázku) prebieha v opačnom poradí a jej substrátom je α-ketoglutarát.78

Reakčný mechanizmus aspartátaminotransferázy
  1. Tvorba interného aldimínu: Najprv sa vytvorí Schiffova báza z ε-amínoskupiny Lys258 a aldehydového uhlíka PLP, čím vznikne interný aldimín.
  2. Transaldiminácia: Interný aldimín sa následne stáva externým aldimínom, keď sa ε-amínoskupina Lys258 nahradí za amínoskupinu aspartátu. Táto reakcia prebieha cez nukleofilný atak deprotonovanou amínoskupinou Asp a prebieha cez tetraedrický intermediát. V tomto kroku sú karboxylové skupiny Asp stabilizované guanidínovými skupinami reziduí Arg386 a Arg292.
  3. Tvorba chinonoidu: Vodík viazaný na α-uhlík Asp sa následne štiepi (predpokladá sa, že Lys258 je akceptorom protónu) za tvorby chinonoidového intermediátu.
  4. Tvorba ketimínu: Chinonoid sa znovu protonuje, ale teraz na aldehydovom uhlíku, čím vzniká ketimínový intermediát.
  5. Hydrolýza ketimínu: Nakoniec sa ketimín hydrolyzuje a vznika PMP a oxalacetát.

Predpokladá sa, že tento mechanizmus má niekoľko čiastočne rýchlosť určujúcich krokov.20 Bolo však preukázané, že väzba substrátu (transaldiminácia) posúva katalytickú reakciu smerom dopredu.21

Klinický význam

upraviť | upraviť zdroj

AST je podobná alanínaminotransferáze (ALT) v tom, že oba enzýmy sú asociované s parenchymatickými bunkami. Rozdiel je v tom, že ALT sa nachádza hlavne v pečeni a jeho koncentrácia v obličkách, srdci a kostrových svaloch je klinicky zanedbateľná. Naproti tomu sa AST nachádza v pečeni, srdci (srdcovom svale), kostrových svaloch, obličkách, mozgu a červených krvinkách.chýba zdroj ALT je teda špecifickejším ukazateľom zápalu pečene oproti AST, keďže AST môže byť zvýšená i pri poruchách ostatných orgánov, ako sú infarkt myokardu, akútna pankreatitída, akútna hemolytická anémia, vážne popáleniny, akútna renálna choroba, choroby kostrových svalov, alebo trauma.22

AST bola definovaná ako biochemický marker pre diagnózu akútneho infarktu myokardu v roku 1954. Stanovenie AST pre túto diagnózu je však aktuálne už redundantné a bolo nahradené srdcovými troponínmi.23

Laboratórne testy by vždy mali byť interpretované s využitím referenčného rozpätia od laboratória, ktoré vykonalo meranie. Príklad je uvedený nižšie:

Pohlavie pacienta Referenčné hodnoty24
Muž 8–40 IU/l
Žena 6–34 IU/l
  1. The structural basis for the altered substrate specificity of the R292D active site mutant of aspartate aminotransferase from E. coli. Protein Eng., March 1994, s. 405–412. DOI10.1093/protein/7.3.405. PMID 7909946.
  2. a b ŠKÁRKA, Bohumil; FERENČÍK, Miroslav. Biochémia. 3. vyd. s.l. : s.n., 1992. ISBN 80-05-01076-1.
  3. Transaminase activity in human blood.. The Journal of Clinical Investigation, January 1955, s. 126–31. DOI10.1172/jci103055. PMID 13221663.
  4. A note on the spectrometric assay of glutamic-oxalaceticñnn transaminase in human blood serum.. The Journal of Clinical Investigation, January 1955, s. 131–3. DOI10.1172/JCI103055. PMID 13221664.
  5. Serum glutamic oxaloacetic transaminase activity in human acute transmural myocardial infarction.. Science, 24 September 1954, s. 497–9. DOI10.1126/science.120.3117.497. PMID 13195683.
  6. GIANNINI, E. G.. Liver enzyme alteration: a guide for clinicians. Canadian Medical Association Journal, 2005-02-01, s. 367–379. ISSN 0820-3946. DOI10.1503/cmaj.1040752. PMID 15684121.
  7. a b Kirsch JF; Eichele G; Ford G. Mechanism of action of aspartate aminotransferase proposed on the basis of its spatial structure. J Mol Biol, 1984, s. 497–525. DOI10.1016/0022-2836(84)90333-4. PMID 6143829.
  8. a b BERG, JM; TYMOCZKO, JL; STRYER, L. Biochemistry. s.l. : W.H. Freeman, 2006. ISBN 978-0-7167-8724-2. S. 656–660.
  9. a b Recent topics in pyridoxal 5'-phosphate enzyme studies. Annu Rev Biochem, 1990, s. 87–110. DOI10.1146/annurev.bi.59.070190.000511. PMID 2197992.
  10. Purification and characterization of aspartate aminotransferase from the halophile archaebacterium Haloferax mediterranei. Biochem J, 1991, s. 149–54. DOI10.1042/bj2780149. PMID 1909112.
  11. An aspartate aminotransferase from an extremely thermophilic bacterium, Thermus thermophilus HB8. J Biochem, 1996, s. 135–44. DOI10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021198. PMID 8907187.
  12. Escherichia coli mutants deficient in the aspartate and aromatic amino acid aminotransferases. J Bacteriol, 1977, s. 429–40. DOI10.1128/JB.130.1.429-440.1977. PMID 15983.
  13. a b c X-ray structure refinement and comparison of three forms of mitochondrial aspartate aminotransferase. J Mol Biol, 1992, s. 495–517. DOI10.1016/0022-2836(92)90935-D. PMID 1593633.
  14. Rhee S; Silva MM; Hyde CC. Refinement and comparisons of the crystal structures of pig cytosolic aspartate aminotransferase and its complex with 2-methylaspartate. J Biol Chem, 1997, s. 17293–302. DOI10.1074/jbc.272.28.17293. PMID 9211866.
  15. Kamitori S; Hirotsu K; Higuchi T. Three-dimensional structure of aspartate aminotransferase from Escherichia coli at 2.8 A resolution. J Biochem, 1988, s. 317–8. DOI10.1093/oxfordjournals.jbchem.a122464. PMID 3071527.
  16. a b c Activity and structure of the active-site mutants R386Y and R386F of Escherichia coli aspartate aminotransferase. Biochemistry, 1991, s. 1980–1985. DOI10.1021/bi00221a035. PMID 1993208.
  17. Domain closure in mitochondrial aspartate aminotransferase. J Mol Biol, 1992, s. 197–213. DOI10.1016/0022-2836(92)90691-C. PMID 1522585.
  18. Dual substrate recognition of aminotransferases. The Chemical Record, 2005, s. 160–172. DOI10.1002/tcr.20042. PMID 15889412.
  19. Mechanism of racemization of amino acids by aspartate aminotransferase. Eur J Biochem, 1992, s. 563–569. DOI10.1111/j.1432-1033.1992.tb16584.x. PMID 1735441.
  20. The reaction catalyzed by Escherichia coli aspartate aminotransferase has multiple partially rate-determining steps, while that catalyzed by the Y225F mutant is dominated by ketimine hydrolysis. Biochemistry, 1996, s. 5280–5291. DOI10.1021/bi952138d. PMID 8611515.
  21. Conformational change in aspartate aminotransferase on substrate binding induces strain in the catalytic group and enhances catalysis. J Biol Chem, 2003, s. 9481–9488. DOI10.1074/jbc.M209235200. PMID 12488449.
  22. AST/ALT online. . Dostupné online.
  23. Gaze DC. The role of existing and novel cardiac biomarkers for cardioprotection. Current Opinion in Investigational Drugs, 2007, s. 711–7. PMID 17729182.
  24. GPnotebook > reference range (AST) Retrieved on Dec 7, 2009 Archivované 7 január 2017 na Wayback Machine
  • JANSONIUS, JN; VINCENT, MG. Biological Macromolecules and Assemblies. Ed. Jurnak FA. New York : Wiley, 1987. ISBN 978-0-471-85142-4. Structural basis for catalysis by aspartate aminotransferase, s. 187–285.
  • Aspartate aminotransferase of Escherichia coli: nucleotide sequence of the aspC gene. J. Biochem., 1985, s. 1259–62. DOI10.1093/oxfordjournals.jbchem.a135173. PMID 3897210.
  • The complete amino acid sequence of aspartate aminotransferase from Escherichia coli: sequence comparison with pig isoenzymes. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1984, s. 62–67. DOI10.1016/0006-291X(84)90439-X. PMID 6378205.
  • Site-directed mutagenesis of Escherichia coli aspartate aminotransferase: role of Tyr70 in the catalytic processes. Biochemistry, 1991, s. 7796–7801. DOI10.1021/bi00245a019. PMID 1868057.

Tento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Aspartate transaminase na anglickej Wikipédii.

Zdroj:
Text je dostupný za podmienok Creative Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších podmienok. Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky použitia.
Zdroj: Wikipedia.org - čítajte viac o Aspartátaminotransferáza





Text je dostupný za podmienok Creative Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších podmienok.
Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky použitia.

Your browser doesn’t support the object tag.

www.astronomia.sk | www.biologia.sk | www.botanika.sk | www.dejiny.sk | www.economy.sk | www.elektrotechnika.sk | www.estetika.sk | www.farmakologia.sk | www.filozofia.sk | Fyzika | www.futurologia.sk | www.genetika.sk | www.chemia.sk | www.lingvistika.sk | www.politologia.sk | www.psychologia.sk | www.sexuologia.sk | www.sociologia.sk | www.veda.sk I www.zoologia.sk